Sebagai salah satu ulama yang disegani, Habib Luthfi Bin Yahya Pekalongan banyak dimintai pendapat oleh para kiai tentang banyak hal. Salah satunya adalah tentang hukum rokok yang memang sudah lama menjadi bahan berbedaan pendapat di kalangan para kiai.
Habib Luthfi sendiri merupakan salah seorang kiai yang membolehkan rokok.
Dalam salah satu kesempatan, Habib Luthfi pernah didatangi oleh rombongan kiai yang hendak bertanya soal status hukum merokok menurut Islam.
Habib Luthfi menyambut para tamunya dengan gembira. Suasana santai terbangun. Hingga kemudian, tiba-tiba Habib Luthfi Bin Yahya yang berada di tengah-tengah kiai tersebut menyalakan sebatang rokok lalu menghisapnya berkali-kali dengan santai tanpa bicara sedikit pun.
Melihat isyarat tersebut, para kiai yang hendak bertanya pun tidak jadi mengutarakan pertanyaan lebih lanjut. Mereka sepertinya paham atas isyarat yang diberikan Habib Luthfi Bin Yahya sudah cukup menjadi jawaban.